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Qu’est-ce que la médecine de précision? Profilage génomique large

Comment concrétisons-nous le potentiel de la médecine de précision?

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Médecine de précision

Le virage vers des traitements personnalisés

La pratique clinique évolue vers une ère de médecine de précision dans laquelle les connaissances moléculaires permettent de personnaliser le traitement en fonction du profil génomique unique de la tumeur du patient.1-3 Le traitement du cancer devient de plus en plus complexe, du fait du nombre croissant de gènes analysés, pour les quels les options thérapeutiques se multiplient.4-8 En 2018, on comptait 849 molécules en stade avancé de développement, dont 91% étaient des thérapies ciblées.9 Une évolution en matière de diagnostic clinique et de prise de décision s’avère nécessaire si nous voulons gérer cette complexité croissante et concrétiser le potentiel de la médecine de précision.4-10
1990 2000 2 0 10 2 0 20 2 0 30 1980 SELON L’ORGANE THÉRAPIE CIBLÉE TRAITEMENTPERSONNALISÉ Le cancer est principalementtraité selon sa localisationdans l’organisme Le traitement du cancer esten fonction de l’organe et duou des biomarqueur(s) altérés Vers un traitement uniqueen fonction du profilgénomique de la tumeurde chaque patient
Altérations génomiques et signatures génomiques

Identifier les informations génomiques pertinentes sur le plan clinique

Il existe quatre classes principales d’altérations génomiques: substitutions de base, insertions et délétions, modifications du nombre de copies et réarrangements de gènes. Mais les méthodes diagnostiques actuellement disponibles peuvent-elles vraiment identifier toutes les altérations? Certains tests de biomarqueurs basés sur des méthodes diagnostiques largement répandues telles que la PCR, l’IHC ou la FISH ainsi que les tests multigéniques de hotspots basés sur le NGS risquent de ne pas détecter des altérations génomiques qui pourraient être essentielles aux schémas thérapeutiques des patients.4,11-13

De plus, des signatures génomiques pan-tumorales  complexes, telles que la charge de mutation tumorale (TMB) et l’instabilité microsatellitaire (MSI), peuvent fournir d’autres informations précieuses qui peuvent contribuer à la personnalisation des stratégie thérapeutiques.14-18 Ces deux signatures génomiques renseignent sur l'éligibilité à l'immunothérapie, indépendamment de l'expression de PD-L1.19-24 Le profilage génomique large est la seule option clinique de routine capable de mesurer la TMB et la bTMB.19-22

MSI TMB/ bTMB Quatre principales classes d’altérations génomiques Substitutions de base Insertions et délétions Altérations dunombre de copies Réarrangements Signatures génomiques Charge mutationnelletumorale / chargemutationnelle tumoralesur le sang* Instabilitémicrosatellitaire

*TMB et MSI sont rapportées part FoundationOne®CDx et FoundationOne®Heme, bTMB et MSI-high rapportés par FoundationOne®Liquid CDx.
Une approche innovante

Une évolution dans le diagnostic et la prise de décision clinique

Afin de garantir que les patientes et patients atteints d’un cancer puissent bénéficier des dernières innovations thérapeutiques, il est nécessaire de développer une approche évolutive en matière de diagnostic clinique et de la prise de décision qui:

  • identifie les modifications génomiques et les signatures génomiques  cliniquement pertinentes ,

  • soutient et facilite la prise de décision clinique et

  • personnalise les schémas thérapeutiques  des patientes et patients.

Un profilage génomiques large est important pour s’assurer que les patients puissent bénéficier d’une thérapie adaptée au profile génomique de leur cancer.1,10,25

"Les recommandations du NCCN (pour le CPNPC) conseillent vivement un profilage moléculaire plus large dans le but d'identifier les mutations rares présentes sur les drivers oncogéniques et pour lesquelles des médicaments efficaces sont déjà disponibles, ou pour conseiller de manière appropriée les patients concernant la disponibilité des essais cliniques. Le profilage moléculaire élargi est un élément clé de l'amélioration des soins aux patients atteints de CPNPC"

Recommandations du NCCN pour le CPNPC version 6, 202025

"Les panels multiplex de profilage génomique sont préférés, lorsqu'ils sont disponibles, à la multiplication des tests sur gènes uniques afin d’identifier d'autres options de traitement que l'EGFR, l'ALK, le BRAF et le ROS1"

Approbation par l'ASCO des recommandations PAC/IASLC/AMP dans le cancer du poumon, 201826,27

AMP: Association for Molecular Pathology (Société de pathologie moléculaire). ASCO: American Society of Clinical Oncology (Société américaine d’oncologie clinique). bTMB: Blood tumour mutational burden (charge mutationnelle tumorale du sang). CAP: College of American Pathologists (Collège américain d’anatomopathologistes). FISH: hybridation in situ par fluorescence. IASLC: International Association for the Study of Lung Cancer (Association internationale pour l’étude du cancer du poumon). IHC: immunohistochimie. MSI: microsatellite instability (instabilité microsatellitaire). NCCN: National Comprehensive Cancer Network. NGS: next generation sequencing (séquençage de nouvelle génération). NSCLC: non-small cell lung cancer (cancer du poumon non à petites cellules). PCR: polymerase chain reaction (réaction en chaîne par polymérase). TMB: tumour mutational burden (charge mutationnelle tumorale). CDx: companion diagnostic.

M-CH-00002385 (juin 2022)

Références
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